Первого сентября 1948 года в Пирита по адресу Метсавахи  теэ начала свою работу Таллиннская 36 неполная средняя школа (с продолжительностью обучения 7 лет). Впервом учебном году школа насчитывала 12 классных комплектов со 132 учащимися, половина из которых обучалась на эстонском языке, а половина – на русском. Первым директором школы был Леонтий Сепп.

В последующие годы число учеников выросло, и в 1949-1950 гг. по адресу Метсавахи тее 19 было построено новое здание (ныне – здание начальной школы). Школой руководили Таисия Куприна (1951-1955) и Хельми Викхольм (1955-1959). 

В 1961 году  школа преобразована в восьмилетнюю, а в 1962 году – в среднюю. В этом же году была осуществлена пристройка к прежнему зданию, там разместились кабинеты химии, физики и труда. Первый выпуск окончил среднюю школу в 1965 году. В 1959-1963 гг. обязанности директора школы исполнял Юло Рандмаа. 

С 1970 года школа начала политехническое трудовое обучение по специальностям «Торговля» и «Электроника». В 1963-1981 гг. школу возглавляла Сирье Тераск. 

В результате капитального ремонта (1981-1982 гг.) был изменён внутренний интерьер школы. В 1983 году получила начало одна из самых красивых традиций школы – бал выпусников. Начиная с 1989 года обучение в школе осуществляется только на эстонском языке. В 1981-1989 директором школы был Дагмар Аренгу. 

В 1992 году Таллиннская 36 средняя школа была переименована в Пиритаскую среднюю школу. Началась подготовка к переходу школы на обучение с экономическим уклоном, и с 1996 года школа получила  название Пиритаская Экономическая гимназия. В 1989-2009 гг. школу возглавляла Эдит Асвейт. 

В 2002 году Пиритаская Экономическая гимназия стала лауреатом конкурса “Kvaliteediauhinnad” («Награды за качество») в номинации “Õppimist väärtustav  kool” («Школа, дорожащая обучением»). В 2003 году осуществлена пристройка для предметных кабинетов гимназии, библиотеки, спортивного комплекса, а в 2004-2005 гг. были обновлены старые здания. 24 января 2009 года был освящён новый флаг школы, и с этого времени 24 января отмечается день рождения школы. 

Начиная с 2008 года каждые два года в гимназии проходят экономические конференции. Экономическое учебное направление с годами превратилось в цельную систему. Школа принимала участие в международных проектах Comenius, Model European Parlament и MULTI, а также организует городские конкурсы – Rising Star, Pirita Dance Show, конкурс поваров. С осени 2009 г. по 2015/2016  уч. г. директором работала Рита Румм. 

Начиная с осени 2016 года Пиритаскую Экономическую гимназию возглавляет Тоомас Пикхоф. В 2019/2020 уч. г. в школе учатся 895 учеников. Благодаря тесному сотрудничеству с местным сообществом вырос престиж школы. В гимназии появилось новое учебное направление – творческое предпринимательство. 

В основной школе обучение основам экономики внедрено в интегрированную учебную программу. В рамках экономического направления на гимназической ступени изучаются такие предметы, как основы предпринимательства и маркетинга, микро- и макроэкономика, бухгалтерский учёт, налогообложение и составление бизнесплана.

При обучении творческому предпринимательству с предпринимательскими предметами комбинируются мультимедийные средства и творческая экономика – фотография, киноисскуство, анимация, основы графического дизайна. Гимназисты участвуют в тренингах, посвящённых развитию навыков общения и творческого начала, совершенствуют письменную речь и знакомятся с основами законадательства.

26 января 2017 была организована для гимназистов г. Таллинна IV экономическая конференция «Экономика завтра и послезавтра – новые вызовы, возможности и перспективы на будущее», которая была признана главным событием в области образования в г. Таллинне в январе 2017 года (Tallinna 2017. aasta jaanuari haridustegu).

9 ноября 2017 года состоялась I медиаконференция «Ориентирование в сфере СМИ – обязанность или свободный выбор?».

Начиная с 2017 года в гимназии проходят фестивали мнений, где кандидаты ученического самоуправления излагают свою точку зрения по различным вопросам школьной жизни.

Весной 2018 года школа выпустила свои деньги, которые можно использовать в рамках различной школьной деятельности, например, на ярмарках и аукционах.

Для учащихся начальных классов весной 2018 года был организован конкурс изобретений «100 изобретений для Эстонии», а осенью прошла научная конференция «100 научных мгновений для Эстонии».

Девиз Пиритаской Экономической гимназии:

HARIDUS TEEB VABAKS – KASVATA SÜDANT TARKUSENI!
ОБРАЗОВАНИЕ ДЕЛАЕТ СВОБОДНЫМ – ВОСПИТЫВАЙ РАЗУМ ЧЕРЕЗ СЕРДЦЕ!